OPTIMALISASI EKSTRAKSI DNA DAN PCR-RAPD PADA Grevillea spp. (PROTEACEAE)
INTISARI: Analisis genetika
molekuler tumbuhan tergantung
pada jumlah dan
kemurnian sampel DNA
serta kondisi optimum reaksi.
Oleh karena itu diperlukan metode yang tepat dalam ekstraksi DNA dan reaksi
molekuler seperti PCR. Penelitian ini bertujuan menentukan metode untuk
mendapatkan DNA dengan berat molekul tinggi dari daun Grevillea serta
menentukan kondisi optimum untuk reaksi PCR-RAPD. Modifikasi metode ekstraksi
DNA standar dari Doyle dan Doyle dengan peningkatan konsentrasi EDTA (50 mM),
penambahan 2% (v/v) 2-mercaptoethanol, serta
inkubasi selama 4-6
jam pada suhu
55oC menghasilkan DNA
dengan kualitas yang
baik dan konsisten. Amplifikasi DNA
menggunakan teknik PCR-RAPD
yang efisien dan
konsisten dapat diperoleh
dengan kondisi komponen reaksi
yang ideal. Pada
Grevillea, pola-pola PCR-RAPD
yang jelas dan
konsisten diperoleh dengan menggunakan 0ng DNA cetakan, 5 pmol
primer, 2.5 mM MgCl2 serta jumlah siklus termal 40 x.
Kata kunci: ekstraksi DNA,
Grevillea, PCR-RAPD
Penulis: MADE PHARMAWATI
Kode Jurnal: jpbiologidd090005
