ABSTRAK: Dewasa ini
telah ditemukan banyak senyawa
antiinflamasi dari bahan alam.
Penelitian ini telah dilakukan
untuk memprediksi mekanisme
kerja senyawa-senyawa anti-inflamasi dari
bahan alam pada tingkat molekuler sebagai
inhibitor COX-2 dengan menggunakan metode Molecular
Docking Simulation. Target yang
dievaluasi adalah interaksi
ikatan hydrogen antara
protein and ligan.
Simulasi docking ini menggunakan program PLANTS (Protein
Ligand Ant System) dengan menggunakan 10 konformasi ligan. Hasil penelitian
dari 22 senyawa
bahan alam dapat
mengikat COX-2 ditunjukkan
dengan energi dan interaksi ikatan hidrogen
(ΔG). Hasil menunjukkan bahwa ikatan
hidrogen (ΔG) terbaik yaitu
senyawa barbaloin (-17,8976 kkal/mol), Interaksi antara barbaloin dengan
COX-2 ditandai dengan adanya 11 ikatan hidrogen
yang terjadi dengan
residu-residu yang ada didalam
binding site dalam
hal ini adalah 2
ikatan hidrogen pada Arg120
(gugus yang terikat
adalah Hidroksil {OH}
dan gugus karbonil
{=O}, 3 ikatan hidrogen pada
Tyr355 (gugus hidroksil),
2 ikatan hidrogen
pada Met522 (gugus
hidroksil), 1 ikatan hidrogen pada
Val523 (gugus hidroksil),
1 ikatan hidrogen
pada Ala527 (gugus
hidroksil), dan 2
ikatan hidrogen pada Ser530
(gugus hidroksil) yang
berarti bahwa barbaloin mampu mengikat daerah
katalitik residu pada COX-2. Dari hasil ini dapat disimpulkan bahwa
senyawa barbaloin memiliki potensi yang baik untuk menghambat COX-2.
Kata kunci: antiinflamasi,
docking, inhibitor COX-2, in silico
Penulis: Mukhtasyam
Zukhrullah, Muhammad Aswad, dan Subehan
Kode Jurnal: jpfarmasidd120035
Artikel Terkait :
