EKSTRAKSI DNA DAN AMPLIFIKASI ITS rDNA ISOLAT FUNGI ENDOFIT LBKURCC67 UMBI TANAMAN DAHLIA (DAHLIA VARIABILIS)
ABSTRAK: Fungi endofit
hidup dalam jaringan
tanaman tanpa membahyakan
sel inangnya dan diketahui
menghasilkan metabolit sekunder
dan enzim ekstraseluler. Fungi LBKURCC67 merupakan
fungi endofit yang
diisolasi dari umbi
tanaman dahlia berbunga kuning
(Dahlia variabilis) di
Padang Panjang, Provinsi
Sumatera Barat. Spesies isolat
fungi LBKURCC67 belum
diketahui secara pasti
karena identifikasimorfologi yang
pernah dilakukan lebih
tepat untuk tingkat
genus. Identifikasi spesies yang
lebih tepat adalah
identifikasi molekuler dengan
menggunakan DNA. Sebelum penentuan spesies
dalam identifikasi molekuler,
tahap yang harus
dilakukan adalah ektraksi dan
amplifikasi DNA. Penelitian
ini bertujuan untuk
ekstraksi DNA dan amplifikasi rDNA
daerah Internal Transcribed
Spacer (ITS) dengan
metode Polymerase Chain Reaction
(PCR). DNA isolat
fungi LBKURCC67 diekstraksi menggunakan Wizard
Genomic DNA Purification
kit ex Promega
Corp. (Madison, USA) dari miselium. Hasil penelitian menunjukkan
ekstraksi DNA berhasil dilakukan dari
miselium yang berumur 4 hari. Kondisi
optimum amplifikasi rDNA dengan metode PCR adalah menggunakan primer ITS5 dan
ITS4 dengan suhu annealing 41°C. Analisis elektroforesis menunjukkan
berat molekul isolat
DNA adalah 16.951
pb dan berat molekul produk PCR adalah 583 pb.
Penulis: Senjavi Rakhmana,
Saryono, Titania T. Nugroho
Kode Jurnal: jpkimiadd150051
