EKSTRAKSI DNA DAN AMPLIFIKASI ITS rDNA ISOLAT FUNGI ENDOFIT LBKURCC67 UMBI TANAMAN DAHLIA (DAHLIA VARIABILIS)

ABSTRAK: Fungi  endofit  hidup  dalam  jaringan  tanaman  tanpa  membahyakan  sel  inangnya  dan diketahui  menghasilkan  metabolit  sekunder  dan  enzim  ekstraseluler.  Fungi LBKURCC67  merupakan  fungi  endofit  yang  diisolasi  dari  umbi  tanaman  dahlia berbunga  kuning  (Dahlia  variabilis)  di  Padang  Panjang,  Provinsi  Sumatera  Barat. Spesies  isolat  fungi  LBKURCC67  belum  diketahui  secara  pasti  karena  identifikasimorfologi  yang  pernah  dilakukan  lebih  tepat  untuk  tingkat  genus.  Identifikasi  spesies yang  lebih  tepat  adalah  identifikasi  molekuler  dengan  menggunakan  DNA.  Sebelum penentuan  spesies  dalam  identifikasi  molekuler,  tahap  yang  harus  dilakukan  adalah ektraksi  dan  amplifikasi  DNA.  Penelitian  ini  bertujuan  untuk  ekstraksi  DNA  dan amplifikasi  rDNA  daerah  Internal  Transcribed  Spacer  (ITS)  dengan  metode Polymerase  Chain  Reaction  (PCR).  DNA  isolat  fungi  LBKURCC67  diekstraksi menggunakan  Wizard  Genomic  DNA  Purification  kit  ex  Promega  Corp.  (Madison, USA)  dari miselium. Hasil penelitian menunjukkan ekstraksi DNA berhasil  dilakukan dari miselium  yang berumur 4 hari. Kondisi optimum amplifikasi rDNA dengan metode PCR adalah menggunakan primer ITS5 dan ITS4 dengan suhu annealing 41°C. Analisis elektroforesis  menunjukkan  berat  molekul  isolat  DNA  adalah  16.951  pb  dan  berat molekul produk PCR adalah 583 pb.

Kata kunci: Endofit, ITS, PCR, rDNA

Penulis: Senjavi Rakhmana, Saryono, Titania T. Nugroho

Kode Jurnal: jpkimiadd150051

Artikel Terkait :

Jp Kimia dd 2015

• Potensi Ekstrak Etanol Daun Lidah Buaya (Aloe vera L.) Sebagai Antifertilitas Melalui Tampilan Imunohistokimia Caspase 3 Aktif Pada Testis Serta Penilaian Kuantitas dan Kualitas Spermatozoa Mencit (Mus musculus L.)
• Pengembangan Bahan Ajar Kimia Inovatif pada Pokok Bahasan Reduksi dan Oksidasi Berdasarkan Kurikulum 2013 Terintegrasi Pendidikan Karakter
• Penerapan Model Pembelajaran Berbasis Masalah Terintegrasi Media Internet Pada Pembelajaran Kimia Larutan Untuk Meningkatkan Hasil Belajar dan Karakter Siswa SMA
• Penerapan Model Problem Based Learning Menggunakan Media Exe Learning untuk Meningkatkan Hasil Belajar dan Kerjasama Siswa Pada Materi Hidrokarbon
• Pengaruh Kadar Raksa Dalam Rambut Terhadap Keparahan Gejala Autisme pada Anak yang Mengalami Gangguan Autistik
• Penerapan Model Quantum Teaching Menggunakan Media Peta Konsep dalam Pembelajaran Struktur Atom di Kelas X SMA
• Pengaruh Model Mengajar Menginduksi Perubahan Konsep Simson Tarigan dan Problem Based Learning dengan Media Ms Frontpage Terhadap Kemampuan Berpikir Kritis dan Hasil Belajar Kimia
• Hubungan C-Reaktif Protein dan Kondisi Udara Tercemar PM10 Dengan Lama Menetap Lansia (Studi Kasus di Kelurahan Kampung Lalang Kota Medan Tahun 2013)
• Efektifitas Media Peta Konsep Untuk Meningkatkan Hasil Belajar Kimia Umum I Mahasiswa Program Studi Pendidikan Matematika Pada Materi Stoikiometri
• Penyediaan Lembar Kerja Siswa Inovatif Larutan Elektrolit dan Non Elektrolit Untuk Siswa SMA
• Pengaruh Penyaringan Secara Tradisional Terhadap Kadar Kesadahan Total Pada Air Sumur Gali di Desa Batang Terap Kecamatan Perbaungan Kab. Serdangbedagai
• Pengaruh Penggunaan Multimedia Berbasis Komputer Terhadap Hasil Belajar Kimia Pada Materi Minyak Bumi di Kelas X SMA N 1 Indralaya
• PENGARUH pH PADA SINTESIS OKSIDA PEROVSKIT ZnTiO3 DENGAN METODE KOPRESIPITASI
• KOMPOSISI MEMBRAN OPTIMUM PADA ELEKTRODE SELEKTIF ION METHANIL YELLOW
• SINTESIS AgNPs SECARA REDUKSI KIMIA MENGGUNAKAN CAPPING AGENT KITOSAN DAN PEREDUKSI GLUKOSA
• PEMULIAAN TANAMAN PADI AROMATIK LOKAL KABUPATEN ENREKANG SULAWESI SELATAN
• PENGEMBANGAN MODEL PENGELOLAAN ARSIP (SURAT) DAN DOKUMEN PEMERINTAH BERBASIS WEB PADA KANTOR PEMERINTAH KABUPATEN SIDRAP PROVINSI SULAWESI SELATAN
• SISTEM INFORMASI PERPUSTAKAAN BERBASIS MS ACCESS PADA JURUSAN ADMINISTRASI NIAGA POLITEKNIK NEGERI UJUNG PANDANG
• EVALUASI PELAKSANAAN STANDAR PENILAIAN GURU IPA BIOLOGI PADA MADRASAH TSANAWIYAH (MTS) NEGERI MODEL MAKASSAR
• Pengaruh pH dan Waktu Terhadap Kemampuan Adsorpsi Mip_TFMAA-co-Egdma
• Produksi dan Uji Aktivitas Enzim Selulase dari Bakteri Bacillus subtilis
• Analisis Antioksidan Ekstrak Etil Asetat Kulit Buah Manggis (Garcinia mangostana L.) Dengan Metode Dpph (1,1difenil-2-pikrilhidrazil)
• Kinetika Biodegradasi Limbah Minyak Bumi Menggunakan Biokompos
• Biosorpsi Bogenvil (Bougainvillea spectabilis Wild) Terhadap Emisi Timbal (Pb) Pada Kendaraan Bermotor
• Identifikasi dan Karakterisasi Senyawa Bioaktif Antikanker dari Ekstrak Etanol Kulit Batang Kayu Bitti (Vitex cofassus)