ISOLASI DNA DAN AMPLIFIKASI PCR DAERAH ITS rDNA FUNGI ENDOFIT UMBI TANAMAN DAHLIA (Dahlia variabilis) LBKURCC69

ABSTRAK: Fungi  endofit  hidup  berkoloni  di  dalam  jaringan  tanaman  yang  sehat  tanpa menimbulkan  kerugian  pada  tanaman  inangnya.  Fungi  endofit  LBKURCC69 merupakan  salah  satu  fungi  endofit  yang  berhasil  diisolasi  dari  umbi  tanaman  dahlia (Dahlia  variabilis).  Identifikasi  morfologi  menunjukkan  bahwa  fungi  endofit LBKURCC69  adalah  Phialophora  fastigiata.  Identifikasi  ini  belum  bisa  memberikan kepastian spesies yang akurat karena banyaknya fungi dengan ciri morfologi yang sama, sehingga  sering  terjadi  kesalahan  identifikasi.  Identifikasi  spesies  yang  lebih  akurat dapat dilakukan dengan  identifikasi  molekular  menggunakan  daerah ITS rDNA.  DNA kromosomal  fungi  endofit  LBKURCC69  berhasil  diisolasi  dengan  berat  molekul 6124  pb.  Amplifikasi  PCR  DNA  fungi  endofit  LBKURCC69  pada  daerah  ITS-1  dan ITS-2  rDNA berhasil dilakukan menggunakan pasangan primer ITS4 dan ITS5 dengan suhu annealing 45ºC dan menghasilkan fragmen DNA dengan berat molekul 537 pb.
Kata kunci : endofit, dahlia, ITS, rDNA
Penulis: Fitri Rahayu, Saryono, Titania T. Nugroho
Kode Jurnal: jpkimiadd150040

Artikel Terkait :