ISOLASI DNA DAN AMPLIFIKASI PCR DAERAH ITS rDNA FUNGI ENDOFIT UMBI TANAMAN DAHLIA (Dahlia variabilis) LBKURCC69
ABSTRAK: Fungi endofit
hidup berkoloni di
dalam jaringan tanaman
yang sehat tanpa menimbulkan kerugian
pada tanaman inangnya.
Fungi endofit LBKURCC69 merupakan salah
satu fungi endofit
yang berhasil diisolasi
dari umbi tanaman
dahlia (Dahlia variabilis). Identifikasi
morfologi menunjukkan bahwa
fungi endofit LBKURCC69 adalah
Phialophora fastigiata. Identifikasi
ini belum bisa
memberikan kepastian spesies yang akurat karena banyaknya fungi dengan
ciri morfologi yang sama, sehingga
sering terjadi kesalahan
identifikasi. Identifikasi spesies
yang lebih akurat dapat dilakukan dengan identifikasi
molekular menggunakan daerah ITS rDNA. DNA kromosomal fungi
endofit LBKURCC69 berhasil
diisolasi dengan berat
molekul 6124 pb. Amplifikasi
PCR DNA fungi
endofit LBKURCC69 pada
daerah ITS-1 dan ITS-2
rDNA berhasil dilakukan menggunakan pasangan primer ITS4 dan ITS5 dengan
suhu annealing 45ºC dan menghasilkan fragmen DNA dengan berat molekul 537 pb.
Penulis: Fitri Rahayu, Saryono,
Titania T. Nugroho
Kode Jurnal: jpkimiadd150040
