SEKUEN ASAM AMINO ANTI WHITE SPOT SYNDROME VIRUS (WSSV) PADA UDANG WINDU (PENAEUS MONODON)
Abstrak: Penelitian ini
bertujuan untuk menentukan urutan homologi asam amino, domain fungsional,
prediksi model struktur protein dan karakteristik gen penyandi anti WSSV dalam
udang windu (Penaeus monodon) berasal dari Kabupaten Indramayu. Metode
penelitian adalah kualitatif analisis deskriptif dengan membandingkan hasil PCR
isolasi gen penyandi anti WSSV dengan urutan data GenBank. Hasil penelitian
menunjukkan bahwa gen urutan pengkodean anti WSSV dalam DNA udang windu berasal
gen Indramayu sekuens homolog dengan Penaeus monodon gen AV, cd complate (no. Aksesi
DQ641258.1) dan Penaeus monodon PMAV (PmAV) mRNA, cd lengkap (no. Aksesi
AY3202750.1). C-type lectin adalah domain fungsional dari urutan asam amino
anti WSSV pada udang windu. Struktur protein pengkodean anti WSSV (c-type
lectin) ditandai dengan adanya sinyal peptida, cluster alpha helix, beta untai dan
ada dalam tiga zona sel. Tipe C lektin menunjukkan bisa membantu meningkatkan
ketahanan udang windu dari kabupaten Indramayu terhadap WSSV dan c-jenis lektin
dapat ditemukan dalam berbagai jenis organisme untuk dikembangkan sebagai zat
imunostimulan.
Penulis: Supriatna, I,
Yustiati, A dan Iskandar
Kode Jurnal: jpbiologidd140016
