Analisis Filogenetik Gen L1 Human Papillomavirus 16 pada Penderita Kanker Serviks di Bandung
Abstract: Infeksi human
papillomavirus (HPV) tipe high risk (hr) yang kronik dapat menyebabkan kanker
serviks. Berbagai genotipe hrHPV telah teridentifikasi dan HPV-16 merupakan
genotipe yang tersering menginfeksi serviks. Fragmen L1 HPV dapat digunakan
untuk mengidentifikasikan asal usul HPV. Tujuan penelitian ini adalah
mengeksplorasi asal usul HPV-16 dengan membuat pohon filogenetik. Metode
penelitian yang digunakan adalah metode deskriptif analisis. Penelitian
dilakukan di Laboratorium Genetika Molekuler Unit Penelitian Kesehatan,
Fakultas Kedokteran Universitas Padjadjaran Bandung pada Februari hingga
Agustus 2013. Isolat biopsi dari pasien kanker serviks disumbangkan oleh
Departemen Kebidanan Fakultas Kedokteran Universitas Padjadjaran, Bandung.
Isolasi DNA dibuat dari biopsi jaringan kanker serviks dan fragmen L1 diamplifikasi
dengan desain primer sendiri. Infeksi dengan HPV-16 dikonfirmasi dengan Linear
Array test (Roche). Sekuens urutan basa kemudian dimasukkan dalam program
filogenetik (MEGA5). Hasil konstruksi menunjukkan isolat pasien kanker serviks
dari Bandung berada dalam satu subgrup dengan HPV asal Asia dan Asia Timur.
Simpulan, cluster HPV Indonesia berada pada galur Asia dan Asia Timur.
Penulis: Fitri Rahmi Fadhilah,
Edhyana K. Sahiratmadja, Ratu Safitri, Ani Melani Maskoen, Herman Susanto
Kode Jurnal: jpkedokterandd150320
