Konstruksi dan Validasi Protokol Skrining Virtual Berbasis Struktur dengan Kode PDB 3MQE, 3NTG, dan 3LN0 untuk Penemuan Inhibitor Siklooksigenase-2 (COX-2)

Abstrak: Seiring dengan tingginya penggunaan obat inhibitor COX-2 di pasaran serta efek samping yang ditimbulkan oleh obat-obat yang beredar saat ini maka penemuan obat inhibitor COX-2 barudibutuhkan untuk mencari obat yang selektif terhadap COX-2 dan memberikan efek samping yang minimal. Salah satu metode yang efektif dan efsien untuk penemuan obat baru yaitu in silico. Telah dilakukan penelitian konstruksi dan validasi protokol skrining virtual berbasis struktur dengan kode protein PDB 3NTG, 3MQE dan 3LN0 menggunakan perangkat lunak PLANTS, SPORES, BKChem dan Open Babel untuk penemuan inhibitor COX-2 baru. Dalam penelitian ini digunakan dataset liganligan aktif COX-2 dan pengecohnya (decoy) dari The directory of useful decoys (DUD) untuk validasi retrospektif protokol, yang terdiri dari 426 inhibitor COX-2 dan 13289 decoy. Berdasarkan kriteria nilai EF20% dan EFmax dalam artikel Huang et al (2006) dan Yuniarti et al (2011) dihasilkan dua protokol menunjukkan hasil yang sangat baik dan baik yaitu protokol tervalidasi AYO_COX2_v.1.1 dan AYO_COX2_v.1.2

Kata kunci: protokol, skrining virtual, inhibitor, COX-2

Penulis: ESTI MUMPUNI, ARGUN WIDARSA, YANTI SUSILAWATI, OISAN, ARIEF NURROCHMAD, HARNO DWI PRANOWO, UMAR ANGGARA JENIE, ENADE PERDANA ISTYASTONO

Kode Jurnal: jpfarmasidd140306

Artikel Terkait :

Jp Farmasi dd 2014

• PENGARUH MOTIVASI KERJA DAN BUDAYA ORGANISASI TERHADAP KINERJA KARYAWAN
• ANALISIS BIAYA TERAPI PASIEN DIABETES MELITUS RAWAT INAP
• ANALISIS BIAYA PERAWATAN FRAKTUR TULANG DALAM PENETAPAN PEMBIAYAAN KESEHATAN BERDASAR INA-CBGS
• PENGARUH REPUTASI, KOMPETENSI, KESUKAAN DAN KEPERCAYAAN MEREK PADA LOYALITAS MEREK (STUDI PADA KONSUMEN KOSMETIK THE BODY SHOP DI DAERAH ISTIMEWA YOGYAKARTA)
• PENGARUH KEPEMIMPINAN DAN BUDAYA ORGANISASI TERHADAP KEPUASAN KERJA KARYAWAN DI YOGYAKARTA
• PENGARUH JENIS TERAPI DAN KARAKTERISTIK PENYAKIT ASMA TERHADAP KUALITAS HIDUP PASIEN ASMA RAWAT JALAN DI RSUD
• ANALISIS NIAT KONSUMEN DALAM PEMANFAATAN PELAYANAN APOTEK
• PENGARUH IKLIM ORGANISASI DAN ATRIBUSI KARYAWAN TERHADAP MOTIVASI KERJA KARYAWAN BBPOM YOGYAKARTA
• ANALISIS PENGARUH ATRIBUT YANG BERHUBUNGAN DENGAN PRODUK DAN PEMBELIAN TERHADAP LOYALITAS: STUDI PADA KONSUMEN PRODUK MARTHA TILAAR DI KABUPATEN BLORA
• EVALUASI PENGGUNAAN ANTIBIOTIK UNTUK TERAPI INFEKSI SALURAN KEMIH PADA PASIEN SINDROM NEFROTIK PEDIATRI
• EVALUASI TERAPI ORAL TERHADAP HASIL TERAPI PASIEN ASMA
• PENGARUH PEMANTUAN APOTEKER TERHADAP KEBERHASILAN TERAPI DAN KUALITAS HIDUP PASIEN TUBERKULOSIS
• PERBANDINGAN KUALITAS HIDUP PASIEN DISPEPSIA YANG MENGGUNAKAN LANSOPRAZOL DENGAN INJEKSI RANITIDIN
• EVALUASI DOSIS WARFARIN DAN HASIL TERAPINYA PADA PASIEN RAWAT JALAN
• PERAN INTERPROFESSIONAL EDUCATION TERHADAP PERSEPSI KETERLIBATAN APOTEKER DALAM KOLABORASI ANTAR PROFESI
• PERBANDINGAN PENURUNAN TEKANAN DARAH SETELAH PEMBERIAN LISINOPRIL MALAM ATAU PAGI HARI
• PENGARUH IMPLEMENTASI CLINICAL PATHWAY TERHADAP LUARAN KLINIK DAN EKONOMIK PASIEN ACUTE CORONARY SYNDROME
• HUBUNGAN PENGETAHUAN, PERSEPSI KUALITAS, DAN NIAT APOTEKER UNTUK MEREKOMENDASIKAN FITOFARMAKA
• PERBANDINGAN RESPON AWAL PEMBERIAN WARFARIN PADA PASIEN OBESITAS DENGAN NON-OBESITAS
• EVALUASI RASIONALITAS PENGGUNAAN ANTIBIOTIK TERHADAP LUARAN PADA PASIEN ANAK PENDERITA PNEUMONIA
• PERBANDINGAN MANFAAT ANTIPLATELET KOMBINASI ASPIRIN DAN KLOPIDOGREL DENGAN ASPIRIN TUNGGAL PADA STROKE ISKEMIK
• HUBUNGAN TINGKAT KEPATUHAN, KEPUASAN TERAPI DENGAN KUALITAS HIDUP PASIEN USIA LANJUT DIABETES MELITUS TIPE 2
• ANALISIS FAKTOR YANG MEMPENGARUHI PELAKSANAAN SISTEM PELAYANAN FARMASI SATU PINTU
• PENGARUH KEPATUHAN DAN POLA PENGOBATAN TERHADAP HASIL TERAPI PASIEN HIPERTENSI
• EVALUASI PENGARUH KONSELING FARMASIS TERHADAP KEPATUHAN DAN HASIL TERAPI PASIEN HIPERTENSI DI POLIKLINIK PENYAKIT DALAM RSUD CILACAP PERIODE DESEMBER 2013 - JANUARI 2014