ANALISIS DELIMITASI JENIS PADA Monascus Spp. MENGGUNAKAN SIDIK JARI DNA ARBITRARY PRIMER PCR
ABSTRAK: Sebuah analisis
delimitasi jenis pada Monascus spp. dengan menggunakan teknik sidik jari DNA AP
PCR (Arbitrary Primer Polymerase Chain Reaction) telah dilakukan. Metode ini
digunakan sebagai salah satu cara untuk identifikasi dan diskriminasi
strain-strain bakteri dalam spesies yang sama. Keunggulan metode ini adalah
hanya menggunakan primer tunggal, tidak dipengaruhi oleh kualitas DNA, dan amplikon
yang umum diantara strain-strain yang diuji dapat teramati. Pada penelitian ini
dianalisis isolat Monascus sp. MM yang berasal dari sumber yang berupa habitat
yang mengandung kadar etanol tinggi dan dua isolat M. purpureus yang diisolasi
dari angkak. Berdasarkan analisis ITS pada hasil penelitian sebelumnya, ketiga
isolat memiliki homologi 99% yang menunjukkan delimitasi jenis yang perlu pengkajian
lebih lanjut. Oleh karena itu dilakukan penelitian untuk memperoleh klarifikasi
pada identitas jenis Monascus yang diuji. Hasil analisis ini mengkonfirmasi
bahwa penggunaan teknik sidik jari AP PCR dapat memperlihatkan delimitasi jenis
dari ketiga isolat Monascus yang diuji. Dengan demikian teknik analisis ini
kemungkinan dapat digunakan untuk memberikan klarifikasi pada taksonomi
Monascus.
Penulis: Nandang Suharna dan Heddy Julistiono
Kode Jurnal: jpbiologidd160599
