IDENTIFIKASI GEN / QTL (Quantitative Trait Loci) SIFAT TOLERAN CEKAMAN ALUMINIUM PADA GALUR-GALUR PADI GOGO
ABSTRAK: Kemampuan pertanian
untuk menyediakan beras sebagai makanan pokok cenderung menurun dengan
berkurangnya areal pertanian padi. Pengembangan lahan untuk pertanian padi
diharapkan dapat dilakukan pada tanah-tanah marjinal, dimana cekaman Aluminium
(Al) merupakan salah satu kendala. Varietas padi toleran cekaman Al diperlukan
utuk meningkatkan produksi beras. Teknologi ini telah diketahui ramah
lingkungan, murah dan mudah diadopsi petani. Galur-galur padi yang berlatar
belakang genetik luas yang memiliki toleransi terhadap cekaman Al telah
dihasilkan dari program pemuliaan. Diversitas plasma nutfah padi lokal toleran
cekaman Al merupakan bahan dasar untuk memperoleh varietas padi toleran cekaman
Al. Tujuan dari penelitian ini adalah menganalisis data keragaman genotype menggunakan
384 marka SNP pada galur-galur terseleksi toleran Al berdasarkan beberapa
pendekatan berbasis teknologi bioinformatika. Berdasarkan analisis struktur
populasi keragaman genotipe menggunakan384 marka SNP pada 26 galur terpilih,
terdapat 5 kelompok yang memiliki kisaran RPA bervariasi. Kelima kelompok
galur-galur tersebut terdeteksi memiliki alel gen/QTL yang berbeda-beda
sehingga karakter toleransinya pun berbeda-beda. Hasil analisis asosiasi
diperoleh 9 marka SNP yang bersifat signifikan. Marka-marka ini dapat diaplikasikan
sebagai marka untuk membantu seleksi dalam program pemuliaan.
Penulis: Dwinita W Utami
Kode Jurnal: jpbiologidd160724
