IDENTIFIKASI POLIMORFIS MARKA-MARKA MOLEKULER YANG DIDUGA BERKAITAN DENGAN KARAKTER DAYA HASIL TINGGI PADA 30 GENOTIP PADI
ABSTRAK: Identifikasi marka
polimorfis yang diduga berasosiasi dengan karakter daya hasil tinggi sangat
penting dilakukan guna aplikasi seleksi berbasis marka dalam rangka perakitan
padi berdaya hasil tinggi. Penelitian ini dilakukan untuk mengidentifikasi 30
genotip padi yang diduga berdaya hasil tinggi dengan menggunakan marka SSR. Amplifikasi
produk PCR dipisahkan dengan menggunakan gel agarose 3% atau polyacrylamide gel
electrophoresis (PAGE) 8%. Tingkat keinformatifan marka dapat ditentukan dengan
cara penghitungan Polymorphic Information Content (PIC). Hasil analisis
menunjukan bahwa marka OSBLE3, RM 282, dan RM 259 memiliki nilai PIC ≥ 0,5.
Marka SSR dan marka gen spesifik yang digunakan untuk mengidentifikasi padi
berdaya hasil tinggi menunjukkan bahwa tiga genotip padi terseleksi dapat
direkomendasikan sebagai tetua donor dalam persilangan diantaranya yaitu
genotip #1 (Fatmawati), #3 (Inpari13), dan #30 (IPB 160-F-3-3-1). Marka
molekuler yang digunakan dapat memperkirakan tingkat polimorfisme dan juga
berguna untuk mengkonfirmasi genotip padi yang berpotensi daya hasil tinggi.
Penulis: Nono Carsono, Pradita
N. Lukman, Farida Damayanti, Untung Susanto, Santika Sari
Kode Jurnal: jpkimiadd140896
