PENGKLASTERAN PASIEN KANKER LEUKEMIA BERDASARKAN DATA EKSPRESI GEN DENGAN MENGGUNAKAN DEKOMPOSISI NILAI SINGULAR

Abstract: Informasi yang terkandung di dalam rangkaian molekular Deoxyribonucleic acid (DNA) makhluk hidup dapat diketahui melaluiteknologi microarray. Data microarray menyajikan data tingkat ekspresi gen yang umumnya berukuran besar. Satu sampel pada data microarray bisa memiliki ribuan atau puluhan ribu gen. Pada penelitian ini diolah data pasien kanker darah (leukemia) yang berukuran 500032dengan entri tak negatif. Data microarray pasien leukemia dapat diolah dengan menggunakan Dekomposisi Nilai Singular sedemikian sehingga sampel yang memiliki sifat yang sama dikelompokkan dalam satu kelompok. Dekomposisi Nilai Singular digunakan untuk mengelompokkan data dengan dua macam keragaman (bi-clustering), yaitu menggunakan nilai vektor singular kedua dan ketiga. Dari implementasi pada data, pasien kanker dapat dikelompokkan menjadi penyakit AML, dan ALL beserta sub tipe penyakit ALL, yakni ALL-T dan ALL-B.

Keywords: Data microarray; leukemia; bi-clustering; dekomposisi nilai singular

Penulis: Evi Noviani, Yoga Satria Putra

Kode Jurnal: jpmatematikadd100096

Artikel Terkait :

Jp Matematika dd 2010

• OPTIMASI DALAM PENENTUAN DOSIS OPTIMAL PADA KEMOTERAPI TUMOR
• INDEKS KEMAMPUAN PROSES BERDASARKAN PROPORSI PERSESUAIAN UNTUK DISTRIBUSI NON NORMAL
• CRITICAL SET OF EDGE MAGIC TOTAL LABELING OF EXPANDING CYCLE GRAPH *
• ESTIMASI MODEL EKSPONENSIAL LIFETIME DENGAN DOUBLE CENSORING
• PENYELESAIAN NUMERIK UNTUK MENENTUKAN NILAI OPTIMAL PADA AMERICAN OPTION DENGAN METODE BEDA HINGGA FULLY IMPLISIT DAN CRANK-NICOLSON
• APLIKASI PROGRAM DINAMIK PADA METODE PELAKSANAAN PENGECORAN PLAT LANTAI
• IDENTIFIKASI STRUKTUR DEPENDENSI DENGAN COPULA (APLIKASI PADA DATA KLIMATOLOGI)
• LINIERITAS INTEGRAL HENSTOCK-PETTIS PADA RUANG EUCLIDE R^n
• MEMBATASI K-KETENGGAAN SIMPUL DALAM PEMBANGKITAN RANDOM GRAPH METODE ERDOS ROYI UNTUK MENINGKATKAN KINERJA KOMPUTASI
• OPTIMALISASI REDUKSI NOISE MENGGUNAKAN CHAIN-CODE TERMODIFIKASI PADA PENDETEKSIAN WAJAH
• PENDEKATAN CART UNTUK MENDAPATKAN FAKTOR YANG MEMPENGARUHI TERJANGKITNYA PENYAKIT DEMAM TIFOID DI ACEH UTARA
• SEBUAH TELAAH ELIPS DAN LINGKARAN MELALUI SEBUAH PENDEKATAN ALJABAR MATRIKS
• IMPLEMENTASI BEBERAPA UJI KENORMALAN OMNIBUS DENGAN PERANGKAT LUNAK R
• MODEL PENYERAPAN OBAT UNTUK INTERVAL DAN DOSIS BERBEDA
• UJI KENORMALAN UNIVARIAT: SUATU KAJIAN PUSTAKA
• BEBERAPA SIFAT IDEAL GELANGGANG POLINOM MIRING: SUATU KAJIAN PUSTAKA
• PEMODELAN ALJABAR MAX-PLUS DAN EVALUASI KINERJA JARINGAN ANTRIAN FORK-JOIN TAKSIKLIK DENGAN KAPASITAS PENYANGGA TAK HINGGA
• CONSTRUCTION OF A h -GENERALIZED STANDARD BROWNIAN SHEET BY MEANS OF LINDEBERG’S CENTRAL LIMIT THEOREM
• INVERSI MODEL BASED UNTUK GAMBARAN LITOLOGI BAWAH PERMUKAAN
• STRUKTUR DAN KOMPOSISI VEGETASI HABITAT JULANG EMAS (ACEROS UNDULATUS) DI GUNUNG UNGARAN JAWA TENGAH
• SOLUSI PERIODIK DARI PERSAMAAN KORTEWEG DE VRIES (KDV) DENGAN OPERATOR BILINIER HIROTA
• KUALITAS DAN MORFOLOGI HASIL ELEKTRODEPOSISI KOBAL PADA SUBSTRAT TEMBAGA TERHADAP PENGARUH RAPAT ARUS DAN ASAM BORAT
• UPTAKE OF NICKEL(II) USING DIMETHYLGLIOXYME CHELATE ANION EXCHANGE RESIN
• KOMUNITAS DIATOM PADA EKOSISTEM MANGROVE PANTAI UTARA JAWA TENGAH