KERAGAMAN GENETIK DAN DISTRIBUSI HAPLOGROUP TRENGGILING (Manis javanica Desmarest, 1822)
Abstrak: Kajian keragaman
genetik dari populasi trenggiling (Manis javanica Desmarest, 1822) belum banyak
dilakukan. Penelitian ini menganalisis sekuen fragmen D-loop DNA mitokondria
trenggiling, yang bertujuan untuk menyelidiki diversitas genetika trenggiling
dari dua populasi, yaitu kawasan konservasi dan lembaga konservasi di Sumatera
Utara dan Jawa. Fragmen D-loop DNA mitokondria yang teramplifikasi sepanjang
1129 pasang basa, terdapat 55 haplotipe dengan 120 situs, dan 12
haplogroup. Tiga frekuensi haplotipe
tertinggi dijumpai pada H-19 (9,09%), H-15 dan H-43 (3,64%), dan lainnya 1,8%.
Jarak genetik antar haplotipe trenggiling berkisar antara 0,001-0,099 dengan
rata-rata 0,012. Jarak genetik haplogroup dengan reference berkisar
0.001-0,019; jarak genetik dalam haplogroup berkisar antara 0,003-0,015; jarak
genetik antar haplogroup berkisar 0,003-0,021, dan jarak genetik antara haplogroup
dengan outgroup berkisar 0,0940,109. Diversitas nukleotida (Pi) sebesar 0,008
dan diversitas haplotipe (Hd) 0,994±0,006, yang menunjukkan keragaman genetik
yang tinggi. Hasil Tajima test pada jarak genetik antar haplotipe populasi
trenggiling menunjukkan nilai D: -2,337 (berbeda nyata pada taraf P<0,1),
sedangkan hasil Fu and Li's test menghasilkan D: -4,444 dan F: -4,337 (berbeda
nyata pada taraf P<0,02). Hal ini merupakan indikator tingginya keragaman
genetik dan ekspansi populasi trenggiling.
Kata Kunci: Trenggiling; DNA
mitokondria; haplotipe; genetika
Penulis: Reny Sawitri, Mariana
Takandjandji, M. S A. Zein, Anita Rianti
Kode Jurnal: jpkehutanandd140217

Artikel Terkait :
Jp Kehutanan dd 2014
- PENGARUH INOKULASI FUNGI MIKORIZA ARBUSKULA TERHADAP PERTUMBUHAN BIBIT SUREN (Toona sureni Merr) DALAM MENUNJANG KEBERHASILAN KONSERVASI EX- SITU
- POLA DAN NILAI LOKAL ETNIS DALAM PEMANFAATAN SATWA PADA ORANG RIMBA BUKIT DUABELAS PROVINSI JAMBI
- INDIKATOR DAN PARAMETER KRITERIA LAHAN UNTUK MONITORING DAN EVALUASI KINERJA SUB-DAS
- SELEKSI HABITAT LUTUNG JAWA (Trachypithecus auratus E. Geoffroy SaintHilaire, 1812) DI TAMAN NASIONAL GUNUNG MERAPI
- ZONASI TAMAN NASIONAL GUNUNG CIREMAI BERDASARKAN SENSITIVITAS KAWASAN DAN AKTIVITAS MASYARAKAT
- POLA SEBARAN DAN ASOSIASI BAYUR (Pterospermum javanicum Jungh.) DI KAWASAN TAMAN NASIONAL GUNUNG RINJANI
- PENGELOLAAN DAN KONSERVASI JENIS ULIN (Eusideroxylon zwageri Teijsm. & Binn.) DI INDONESIA
- KESESUAIAN JENIS POHON PADA LAHAN KRITIS DI SUB DAS LESTI, JAWA TIMUR
- FAKTOR PENYEBAB KEGAGALAN PANEN MADU HUTAN DI TAMAN NASIONAL DANAU SENTARUM PADA MUSIM PANEN TAHUN 2009-2012
- PERSEPSI MASYARAKAT TERHADAP PEMBANGUNAN PENANGKARAN RUSA SAMBAR (Cervus unicolor Kerr, 1792) DI KHDTK SAMBOJA, KALIMANTAN TIMUR
- KOMUNITAS HABITAT BEKANTAN (Nasalis larvatus Wurmb) PADA AREAL TERISOLASI DI KUALA SAMBOJA, KALIMANTAN TIMUR
- TRADISI PELESTARIAN HUTAN MASYARAKAT ADAT TAU TAA VANA DI TOJO UNA-UNA SULAWESI TENGAH
- KARAKTERISTIK VEGETASI HABITAT BANTENG (Bos javanicus d’Alton 1832) DI TAMAN NASIONAL MERU BETIRI, JAWA TIMUR
- NILAI FINANSIAL PENANGKARAN RUSA TIMOR DI HUTAN PENELITIAN DRAMAGA, BOGOR
- KANDUNGAN BIOMASSA ATAS PERMUKAAN PADA HUTAN RAWA GAMBUT DI KABUPATEN ROKAN HILIR, PROVINSI RIAU
- PERBEDAAN SIMPANAN KARBON ORGANIK PADA HUTAN TANAMAN Acacia Mangium Wild DAN HUTAN SEKUNDER MUDA
- KERAGAMAN GENETIK DAN SITUS POLIMORFIK TRENGGILING (Manis javanica Desmarest, 1822) DI PENANGKARAN
- KARAKTERISTIK PETANI DAN PRAKTEK SILVIKULTUR AGROFORESTRI KAYU BAWANG (Azadirachta excelsa (jack) M. Jacobs) DI KABUPATEN BENGKULU TENGAH
- PERBANDINGAN HIBRID ULAT SUTERA (Bombyx mori L.) ASAL CINA DENGAN HIBRID LOKAL DI SULAWESI SELATAN
- UJI EFIKASI EKSTRAK DAUN DAN BIJI DARI TANAMAN SUREN, MIMBA DAN SIRSAK TERHADAP MORTALITAS HAMA ULAT GAHARU
- EVALUASI AWAL KOMBINASI UJI SPESIES-PROVENAN JENIS-JENIS SHOREA PENGHASIL TENGKAWANG DI GUNUNG DAHU, BOGOR, JAWA BARAT
- EFEKTIVITAS JENIS DAN DOSIS FUNGISIDA SERTA PEMANGKASAN DALAM MENEKAN PERTUMBUHAN PENYAKIT KARAT TUMOR
- CURAHAN WAKTU KERJA SEBAGAI INDIKATOR KEBERHASILAN PENGELOLAAN HUTAN RAKYAT ”WANAFARMA ” DI KECAMATAN MAJENANG KABUPATEN CILACAP
- VARIASI MUTU FISIOLOGIS BENIH DAN PERTUMBUHAN BIBIT SENGON DARI BEBERAPA PROVENAN ASAL PAPUA