OPTIMASI PCR (POLYMERASE CHAIN REACTION) UNTUK DETEKSI ENDOPARASIT YANG MENYERANG TELUR DAN LARVA IKAN TUNA SIRIP KUNING (Thunnus albacares)
Abstract: Endoparasit
merupakan parasit yang menginfeksi dan terdapat di dalam tubuh inang,
endoparasit ini telah menginfeksi telur dan larva ikan tuna sirip kuning.
Tujuan dari penelitian adalah untuk mengetahui metode deteksi dan infeksi dari
endoparasit ini secara molekuler dengan teknik PCR (Polymerase Chain Reaction).
Telur dan larva yang terinfeksi dikumpulkan dari bak pemeliharaan untuk
dianalisis. Sampel diekstraksi dengan menggunakan metode lysis bufer dan
trizol. Hasil analisis menunjukkan lysis bufer memberikan pola pita yang lebih
jelas dan bersih. Primer P2: 1322f (2F) CCGGAACTTTAGAGTATCGG; 1680r (2R)
TCGGTTCAG ACTGA ACCAAG menghasilkan pola pita yang konsisten dan jelas dengan
panjang fragmen 350 bp. Hal ini mengindikasikan bahwa endoparasit (Ichtyodinium
chambelardi) menyerang telur ikan tuna di dalam bak terkontrol dan infeksinya
terjadi adalah secara horisontal yang berasal dari air media pemeliharaan
Keywords: endoparasit;
deteksi; Polymerase Chain Reaction; tuna sirip kuning
Penulis: Gusti Ngurah Permana,
Jhon Harianto Hutapea, Haryanti Haryanti
Kode Jurnal: jpperikanandd100231